NiSspa: software de código abierto para la caracterización de aislados de Staphylococcus aureus por spa-typing para epidemiología molecular

Abstract

Staphylococcus aureus es un patógeno versátil capaz de causarinfecciones en humanos y animales con diferentes tipos de patologías.El gen spa de S. aureus presenta secuencias cortas repetidas (SSR’s)que se utilizan en la técnica de spa-typing para la caracterizaciónmolecular de aislados del patógeno con fines epidemiológicos. Lasbases de datos y los diferentes tipos de software disponibles para spatypingson poco amigables y presentan la información fragmentada.En este trabajo se presenta una aproximación al diseño de unsoftware alternativo, NiSspa (Nicolaita-software para spa-typing),que relaciona de forma amigable la información de spa-typing con lainformación presente en las bases de datos globales de epidemiologíamolecular de S. aureus. El software se probó contra las herramientasdisponibles en línea utilizando datos experimentales generados enel laboratorio.